Nach 1945 gehörte sie mit ihrem Mann Otto zu den aktivsten Sozialdemokraten in Göttingen: Wiederaufbau der Naturfreunde- und Arbeiterwohlfahrt sind ihr Werk. In ihrer Arbeit als Ratsherrin hat sie sich engagiert den Problemen der Jugend- und Sozialpolitik zugewandt. Über Jahrzehnte war sie Vorsitzende der Arbeiterwohlfahrt (AWO) in Göttingen.
1973 wurde sie zur Ehrenbürgerin der Stadt Göttingen ernannt.
Else Wagener starb am 19. Januar 1997.